transportor MFS muropeptidic AmpG;

căutare

transportor MFS muropeptidic AmpG;

AmpG și transportoare similare ale Superfamiliei Facilitatorului Major; AmpG acționează ca o permează a membranei interne în sistemul de inducere a beta-lactamazei și în reciclarea peptidoglicanului. Transportă meuropeptida din periplasmă în citosol în bacteriile gram-negative, care este esențială pentru inducerea ampC care codifică beta-lactamaza. Familia AmpG aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

Permeasa de tip AmpG; [Procese celulare, adaptări la condiții atipice]

Superfamilie Facilitator Major;

Permeață de eflux arabinoză prevăzută, familia MFS [Transportul și metabolismul carbohidraților];

transportor MFS muropeptidic AmpG;

transportor muropeptidic; Revizuit

AmpG și transportoare similare ale Superfamiliei Facilitatorului Major; AmpG acționează ca o permează a membranei interne în sistemul de inducere a beta-lactamazei și în reciclarea peptidoglicanului. Transportă meuropeptida din periplasmă în citosol în bacteriile gram-negative, care este esențială pentru inducerea ampC care codifică beta-lactamaza. Familia AmpG aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

Permeasa de tip AmpG; [Procese celulare, adaptări la condiții atipice]

Domeniul superfamiliei facilitator principal care conține 3 proteine; Domeniul de suprafață al facilitatorului principal care conține 3 proteine ​​(MFSD3) este un transportor de acetil-CoA prevăzut. Ca purtător de solut atipic, legat de membrană (SLC), MFSD3 este cel mai probabil să fie funcțional activ în membrana plasmatică și nu în organite intracelulare. MFSD3 aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) al proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur sit de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

transportor siderofor, familia RhtX/FptX; RhtX din Sinorhizobium meliloti 2011 și FptX din Pseudomonas aeruginosa par a fi transportori polipeptidici unici, din familia facilitatorilor majori (vezi pfam07690) pentru importul de siderofori ca mijloc de import al fierului. Această funcție a fost sugerată de apropierea de genele de biosinteză a sideroforilor și apoi confirmată de un studiu al fenotipurilor de knockout și de expresie heterologă. [Proteine ​​de transport și legare, cationi și compuși care transportă fierul]

Superfamilie Facilitator Major;

Macrolide eflux protein A și proteine ​​similare ale Facilitatorului Major Superfamilia de transportatori; Această familie este compusă din proteina de eflux macrolidă Streptococcus pyogenes A (MefA) și transportoare similare, dintre care multe rămân necaracterizate. Unii membri pot fi transportori cu rezistență multidrog (MDR), care sunt antiportatori de medicamente/H + (DHA) care mediază efluxul unei varietăți de medicamente și compuși toxici, conferind rezistență acestor compuși. MefA conferă rezistență la macrolide cu 14 membri, inclusiv eritromicină și la macrolide cu 15 membri. Funcționează ca o pompă de eflux pentru a regla nivelurile de macrolide intracelulare. Familia asemănătoare cu MefA aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

familia bacteriană purtătoare de solut 18 MdtG și eucariotă (SLC18) a Superfamiliei de transportatori a facilitatorului major; Această familie este compusă din transportori ai familiei purtător de solut eucariot 18 (SLC18) și transportori de rezistență bacteriană multidrog (MDR) care includ mai multe proteine ​​din Escherichia coli, cum ar fi proteina de rezistență la multe medicamente MdtG, de la Bacillus subtilis, cum ar fi proteinele de rezistență la multe medicamente 1 (Bmr1) (Bmr2) și din Staphylococcus aureus, cum ar fi proteina NorA de rezistență la chinolonă. Familia include, de asemenea, transportoare de eflux de arabinoză Escherichia coli YfcJ și YhhS. Transportorii MDR sunt antiportatori de medicamente/H + (DHA) care mediază efluxul unei varietăți de medicamente și compuși toxici și conferă rezistență acestor compuși. Familia de transportoare SLC18 include transportoare de monoamină veziculare (VAT1 și VAT2), transportor de acetilcolină veziculară (VAChT) și SLC18B1, care se propune a fi un transportor de poliamină veziculară (VPAT). Familia MdtG/SLC18 aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

Acetil-coenzima A transportor 1; Șoarecele Acatn este o proteină hidrofobă de 61 kDa cu șase până la 10 domenii transmembranare. Se pare că promovează 9-O-acetilarea în gangliozide.

Escherichia coli YfcJ, YhhS și transportatori similari ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această subfamilie este compusă din proteine ​​de membrană Escherichia coli, YfcJ și YhhS, transportor de tip MFS necaracterizat YwoG Bacillus subtilis și proteine ​​similare. YfcJ și YhhS sunt transportatori supuși de eflux de arabinoză. YhhS a fost implicat în rezistența la glifosat. Transportorii de eflux de arabinoză asemănători cu YfcJ aparțin familiei bacteriene purtătoare de solut 18 (SLC18) asemănătoare MdtG și eucariotică a superfamiliei de facilitatori majori (MFS) a transportorilor. Se crede că proteinele MFS funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Pompa de eflux ribonucleozidic purinic NepI și transportori similari ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această familie este compusă din pompe de eflux purinic precum Escherichia coli NepI și Bacillus subtilis PbuE, transportoare de eflux de zahăr precum Corynebacterium glutamicum arabinose efflux permease, transportoare de rezistență multidrog (MDR), cum ar fi proteina de rezistență Streptomyces lividans cloramfenicol (CmlR). NepI și PbuE sunt implicate în efluxul de ribonucleozide purinice precum guanozină, adenozină și inozină, precum și baze purinice precum guanină, adenină și hipoxantină și analogi bazici purinici. Acestea joacă un rol în menținerea bazinelor de bază purinice celulare, precum și în protejarea celulelor și conferirea rezistenței împotriva analogilor de bază purinici toxici, cum ar fi 6-mercaptopurina. Transportorii MDR sunt antiportatori de medicamente/H + (DHA) care mediază efluxul unei varietăți de medicamente și compuși toxici și conferă rezistență acestor compuși. Familia asemănătoare NepI aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Transportor de hexuronat, transportor de glucarat și transportori similari ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această familie este compusă din transportori preponderent bacterieni pentru hexuronat (ExuT), glucarat (GudP), galactarat (GarP) și galactonat (DgoT). Aceștia mediază absorbția acestor compuși în celulă. Acestea aparțin Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

YcaD și transportatori similari ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această familie este compusă din transportor YcaD de tip MFS Escherichia coli, transportor de tip MFS Bacillus subtilis YfkF și proteine ​​similare. Sunt transportori necaracterizați care aparțin Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

H + proteină antiporter; [Proteine ​​de transport și legare, cationi și compuși purtători de fier]

Proteine ​​de transport MFS/zahăr; Această familie face parte din superfamilia facilitatorului major al proteinelor de transport membranar.

Permeață de eflux arabinoză prevăzută, familia MFS [Transportul și metabolismul carbohidraților];

Bacillus subtilis YxlH și transportori similari ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această subfamilie este compusă din Bacillus subtilis YxlH transportor de tip MFS necaracterizat YxlH și proteine ​​similare. Funcția biologică a lui YxlH rămâne neclară. Subfamilia asemănătoare YxlH aparține familiei bacteriene purtătoare de solut 18 asemănătoare MdtG și eucariotă (SLC18) a Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a transportatorilor. Se crede că proteinele MFS funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Simporter Na +/melibioză sau transportor înrudit [Transportul și metabolismul carbohidraților];

Familia transportorului de eflux de zahăr (Set) al Facilitatorului Major Superfamilia de transportatori; Această familie este compusă din transportoare de zahăr precum Escherichia coli Sugar eflux transporter SetA, SetB, SetC și alți transportori de zahăr. SetA, SetB și SetC sunt implicate în efluxul de zaharuri precum lactoză, glucoză, IPTG și glucozide sau galactozide substituite. Ele pot fi implicate în detoxifierea analogilor zahărului nemetabolizabili. Familia Set aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

Transportor de tip MFS YcxA și proteine ​​similare ale superfamiliei facilitatorilor majori de transportori; Acest grup este compus din transportoare bacteriene necaracterizate de tip MFS, inclusiv Bacillus subtilis YcxA și YbfB. Sa demonstrat că YcxA facilitează exportul de surfactină în B. subtilis. Grupul asemănător YcxA aparține familiei asemănătoare transportorului monocarboxilat (asemănător MCT) a Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană. Se crede că proteinele MFS funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Glicoproteina 2 a veziculelor sinaptice Metazoan (SV2) și transportorii de molecule mici înrudiți ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această familie este compusă din glicoproteina 2 a veziculelor sinaptice metazoane (SV2) și transportori de molecule mici înrudiți, inclusiv cei care transportă fosfat anorganic (Pht), compuși aromatici (PcaK și proteine ​​înrudite), prolină/betaină (ProP), alfa-cetoglutarat (KgtP), citrat (CitA), shikimate (ShiA) și cis, cis-muconat (MucK), printre altele. SV2 este o proteină asemănătoare unui transportor care servește ca receptor pentru neurotoxina botulinică A (BoNT/A), una dintre cele șapte neurotoxine produse de bacteria Clostridium botulinum. BoNT/A blochează eliberarea neurotransmițătorului prin scindarea proteinei asociate cu sinaptozomii de 25 kD (SNAP-25) în terminalele nervoase presinaptice. De asemenea, este inclusă în această familie proteina legată de vezicula sinaptică 2 (SV2) (SVOP) și proteine ​​similare. SWOP este o proteină de legare a nucleotidelor asemănătoare unui transportor care se localizează pe veziculele care conțin neurotransmițător. Familia asemănătoare SV2 aparține Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

Transportor Shikimate și proteine ​​similare ale Superfamiliei Facilitatorului Major; Această subfamilie este alcătuită din transportorul shikimate Escherichia coli (ShiA), proteina YhjE de transport a metabolitului membranei interne și alți transportatori putabili de metabolit. ShiA este implicat în absorbția shikimatei, un compus aromatic implicat în biosinteza sideroforilor. S-a sugerat că YhjE poate intermedia absorbția osmoprotectoarelor. Subfamilia asemănătoare ShiA aparține glicoproteinei 2 metazoiice sinaptice a veziculelor (SV2) și a familiei de transportori de molecule mici (asemănătoare SV2) a Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană. Se crede că proteinele MFS funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Oxalat: antiporter de formiat (OFA) și proteine ​​similare ale Superfamiliei de transportatori a facilitatorului major; Această subfamilie este alcătuită din oxalat de formigeni Oxalobacter: antiporter de formiat (OFA sau OxlT) și proteine ​​similare. O. formigenes, un comensal care se găsește în intestinul animalelor și al oamenilor, joacă un rol important în eliminarea oxalatului dietetic din tractul intestinal, care este realizat de OFA/OxlT, un transportor de anioni care facilitează schimbul de oxalat divalent cu formiat monovalent, produsul decarboxilării oxalatului. Acest schimb generează un gradient electrochimic de protoni și este sursa de energie pentru sinteza ATP în această celulă. Subfamilia de tip OFA aparține familiei asemănătoare transportorului monocarboxilat (asemănător MCT) a Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană. Se crede că proteinele MFS funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Superfamilie Facilitator Major;

Proteine ​​MdtH cu rezistență la multe medicamente și transportoare similare cu rezistență la multe medicamente (MDR) ale Superfamiliei Facilitatorului Major; Această familie este compusă din Escherichia coli MdtH și transportori similari de rezistență la multe medicamente (MDR) de la bacterii și arhee, dintre care multe rămân necaracterizate. Transportorii MDR sunt antiportatori de medicamente/H + (DHA) care mediază efluxul unei varietăți de medicamente și compuși toxici și conferă rezistență acestor compuși. MdtH conferă rezistență la norfloxacină și enoxacină. Transportorii MDR de tip MdtH aparțin Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) al proteinelor de transport membranar, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare cu comutator basculant.

Transportor de hexuronat, transportor de glucarat și transportori similari ai Superfamiliei Facilitatorului Major; Această familie este compusă din transportori preponderent bacterieni pentru hexuronat (ExuT), glucarat (GudP), galactarat (GarP) și galactonat (DgoT). Aceștia mediază absorbția acestor compuși în celulă. Acestea aparțin Superfamiliei Facilitatorului Major (MFS) a proteinelor de transport de membrană, despre care se crede că funcționează printr-un singur site de legare a substratului, mecanism de acces alternativ care implică un tip de mișcare de tip rocker-switch.

  • Marchler-Bauer A și colab. (2017), "CDD/SPARCLE: clasificarea funcțională a proteinelor prin intermediul arhitecților domeniului subfamiliei.", Acizi nucleici Res.45(D) 200-3.
  • Marchler-Bauer A și colab. (2015), "CDD: baza de date a domeniului conservat de NCBI.", Acizi nucleici Res.43(D) 222-6.
  • Marchler-Bauer A și colab. (2011), "CDD: o bază de date a domeniului conservat pentru adnotarea funcțională a proteinelor.", Acizi nucleici Res.39(D) 225-9.
  • Marchler-Bauer A, Bryant SH (2004), „Căutare CD: adnotări de domeniu proteic din mers.”, Acizi nucleici Res.32(W) 327-331.

Faceți clic pe triunghi pentru a vizualiza detalii despre caracteristică, inclusiv o aliniere de secvență multiplă a secvenței de interogare și secvențele de proteine ​​utilizate pentru curatarea modelului de domeniu, unde semnele de hash (#) deasupra secvențelor aliniate arată locația reziduurilor de caracteristici conservate.