George Thompson

Profesor Asociat

Birou: ECHI 4114
Telefon: 252-744-3368
E-mail: [email protected]

  • Profesor asociat/profesor asistent, Facultatea de Medicină din Chicago, Universitatea de Medicină și Științe Rosalind Franklin (2008-2018)
  • Fiziolog asistent de cercetare, Universitatea din California Los Angeles (2005-2007)
  • Cristalograf senior, Consorțiul de genomică structurală, Universitatea din Toronto (2004-2005)
  • Postdoctoral Fellow, California Institute of Technology/Howard Hughes Medical Institute (2002-2004)
  • Doctorat Biofizică, Iowa State University of Science and Technology (2001)
  • DOMNIȘOARĂ. Biochimie, Iowa State University of Science and Technology (1997)
  • B.S. Biofizică, Universitatea de Știință și Tehnologie din Iowa (1997)

Prezentare generală a cercetării

Principalul meu interes de cercetare este relația structură-funcție în proteinele de membrană și aplicarea acesteia la descoperirea medicamentelor. Proteinele de membrană mediază schimbul celular de energie, substanțe nutritive și informații. Acestea sunt extrem de relevante pentru fiziologia și boala umană (de exemplu, depresie, diabet, rezistență la mai multe medicamente). Proiectarea rațională a medicamentelor se bazează pe înțelegerea bazei moleculare a funcției unei proteine. Cu toate acestea, determinarea structurii tridimensionale a proteinelor de membrană continuă să fie o sarcină dificilă; mai puțin de 1% din structurile lor sunt cunoscute. Sunt interesat în special de proteinele de transport secundar, membre ale uneia dintre cele mai mari superfamilii de proteine ​​de membrană, Superfamilia Facilitatorului Major (MFS). Tehnica structurală de alegere pentru proteinele MFS este cristalografia cu proteine ​​cu raze X. În laboratorul nostru, aplicăm metodologii de mare viteză pentru exprimarea și cristalizarea proteinelor. Pe lângă cristalografia cu proteine ​​cu raze X, folosim în mod obișnuit biochimia proteinelor de membrană, biologia moleculară și modelarea structurală.

Inhibitor specific GLUT5, MSNBA, în cavitatea de legare a substratului GLUT5.

Depozitarea acidului salicilic în plante:

Acidul salicilic (SA) este un hormon vegetal implicat în reglarea răspunsurilor la stresul plantelor, inclusiv răspunsurile patogene locale și sistemice. SA este stocat ca un conjugat de glucoză sub formă fie de glucoză SA (SAG), fie de ester de glucoză SA (SGE), iar aceste reacții de conjugare sunt catalizate de glucoziltransferaze. În organismul model Arabidopsis thaliana, enzima UGT74F1 formează SAG în timp ce UGT74F2 formează în primul rând SGE, totuși, UGT74F1 și UGT74F2 au o similitudine de 90% la nivelul aminoacizilor. Prin biologia structurală, biochimia și biologia moleculară, ne propunem să înțelegem modul în care SA este procesată și stocată în celula plantei.

Structuri cristaline ale UGT74F2. Structura generală cu secțiune longitudinală prin situl activ (stânga). Prim-plan al site-ului activ care prezintă site-ul de legare pentru glucoză UDP (dreapta).

Publicații selectate

Ferraris, R.P., Choe, J. și Patel, C.R. (2018) „Absorbția intestinală a fructozei”. Revizuirea anuală a nutriției. 38, [Epub înainte de tipărire].

Culbertson, A.T., Ehrlich, J.J., Choe, J., Honzatko, R.B. și Zabotina, O.A. (2018) „Structura xiloglucanului xilosiltransferazei 1 dezvăluie reguli sterice simple care definesc tiparele biologice ale polimerilor de xiloglucan.” Proc. Natl. Acad. Știință. U. S. A. 115, 6064-6069.

Schmidl, S., Iancu, C.V., Choe, J. și Oreb, M. (2018) „Ligand Screening Systems for Human Glucose Transporters as Tools in Drug Discovery” Frontiers in Chemistry. 6, 183.

George Thompson, A.M., Iancu, C.V., Neet, K.E., Dean, J.V. și Choe, J. (2017) „Diferențele în modul de legare a substratului și mecanismul catalitic conduc la conjugate de glucoză ale acidului salicilic distincte de către UGT74F1 și UGT74F2 de Arabidopsis thaliana.” Rapoarte științifice 7, 46629.

Thomik, T., Wittig, I., Choe, J., Boles, E. și Oreb, M. (2017) „Un transport artificial de metabolon facilitează utilizarea îmbunătățită a substratului în drojdie”. Natura Biologie Chimică. 13, 1158-1163.

Vaca, E., Behrens, C., Theccanat, T., Choe, J. și Dean, J.W. (2017) „Diferențe mecaniciste în absorbția conjugatului de glucoză cu acid salicilic de veziculele îmbogățite cu membrană vacuolară izolate din Arabidopsis thaliana.” Fiziolul celulelor vegetale. 161, 322-338.

Tripp, J., Essl, C., Iancu, C., Boles, E. Choe, J. și Oreb, M. (iulie 2017) „Stabilirea unui sistem de screening pe bază de drojdie pentru descoperirea inhibitorilor și activatorilor GLUT5 umani . ” Rapoarte științifice 7, 6197

George Thompson, A.M., Ursu, O., Iancu, C.V., Babkin, P, Oprea, T.I. și Choe, J. (2016) „Descoperirea unui inhibitor specific al GLUT5 uman prin screening virtual și evaluarea transportului in vitro”. Rapoarte științifice 6, 24240.

Jordan, P., Choe, J., Boles, E. și Oreb, M. (2016) „Hxt13, Hxt15, Hxt16 și Hxt17 din Saccharomyces cerevisiae reprezintă un tip nou de transportori de polioli.” Rapoarte științifice 6, 23502.

Milton, M.E., Choe, J., Honzatko, R.B., Nelson, S.W. (2016) „Structura cristalină a ADN polimerazei apicoplastice din Plasmodium falciparum: prima privire la o ADN polimerază„ atipică ”a familiei A”. Journal of Molecular Biology 428, 3920-3934.

Mandal, T., Shin, S., Aluvila, S., Chen, HC, Grieve, C., Choe, J., Cheng, EH, Hustedt, EJ și Oh, KJ (2016) „Adunarea homodimerilor Bak în homooligomeri de ordin superior în porul apoptotic mitocondrial. ” Rapoarte științifice 6, 30763.

Milton, M.E., Choe, J., Honzatko, R.B., Nelson, S.W. (2015) „Cristalizarea și analiza preliminară cu raze X a ADN polimerazei Plasmodium falciparum apicoplast.” Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Comun. 71, 333-337.

Babkin, P, George Thompson, A.M., Iancu, C.V., Walters, D.E. și Choe, J. (2015) „Antipsihoticele inhibă transportul glucozei: determinarea sitului de legare a olanzapinei în Staphylococcus epidermidis glucose/H + symporter.” FEBS OpenBio 5, 335-340.

George Thompson, A.M., Iancu, C.V., Nguyen, T.T.H. Kim, D. și Choe, J. (2015) „Inhibarea GLUT1 și GLUT5 umane de către produsele din carbohidrați din plante; informații despre specificul transportului. ” Rapoarte științifice 5, 12804.

Choe, J. (2015) „Cristalografia ca artă: dezvăluirea funcționării interioare a unui transportor de glucoză”. Acad. Medicină 90, 1631.