Jun Zhang

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare a tehnologiei ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

efectul

Haitao Shi

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare a tehnologiei ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

2 Departamentul de științe ale animalelor și păsărilor, Universitatea din Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada

Yajing Wang

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare a tehnologiei ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

Shengli Li

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare a tehnologiei ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

Zhijun Cao

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare a tehnologiei ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

Shoukun Ji

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare în tehnologia ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

Yuan He

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare a tehnologiei ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

Hongtao Zhang

1 Laborator cheie de stat pentru nutriția animalelor, Centrul de cercetare în tehnologia ingineriei din Beijing pentru controlul calității și siguranței laptelui crud, Colegiul de știință și tehnologie a animalelor, Universitatea agricolă din China, Beijing, China

Date asociate

Abstract

Introducere

Rumenul este un ecosistem microbian complex și este locuit de o densitate mare de microbiote rezidente, cu bacterii, protozoare ciliate, ciuperci anaerobe și arhee implicate (Hobson și Stewart, 1997). Microorganismele din rumeni joacă un rol important în degradarea furajelor și în producția de acizi grași volatili (VFA), lactat, aminoacizi, lipide și hidrogen, care sunt cruciale pentru întreținerea, creșterea și performanța producției rumegătoarelor (Shabat și colab.)., 2016). Datorită complexității ecosistemului rumenului, o mai bună înțelegere a microbiotei ruminale în condiții extinse de hrănire este o condiție prealabilă necesară pentru manipularea microbiotei rumenale pentru a optimiza funcția rumenului și a îmbunătăți eficiența hranei (Jami și Mizrahi, 2012; Bannink et al., 2016).

În zilele noastre, tehnica de secvențiere MiSeq de mare capacitate dezvoltată recent a fost utilizată cu succes pentru a dezvălui schimbările și funcțiile comunității de bacterii ruminale (Mao și colab., 2015; Jin și colab., 2016; Ye și colab., 2016). O investigație integrată a compozițiilor și a abundențelor de bacterii ruminale, ciliate, ciuperci și arhee ar putea oferi o mai bună înțelegere a microbiotei în junincele alimentate la limită cu diete cu concentrat ridicat. Am emis ipoteza că o gamă largă de F: C din dietă ar afecta microbiota ruminală și metaboliții. Obiectivul acestui studiu, utilizând patru niveluri dietetice de F: C, a fost de a evalua atât efectele liniare, cât și neliniare ale creșterii proporției concentratului dietetic asupra profilelor ruminale ale microbiotei (bacterii, protozoare, ciuperci anaerobe și arhee) și metaboliți la junincile Holstein alimentate la limită printr-o combinație a strategiei de secvențiere MiSeq și a tehnicii GC-TOF/MS. Mai mult, relațiile dintre abundența microbiotei ruminale și metaboliți au fost, de asemenea, analizate în prezentul studiu.

Materiale și metode

Animale, diete și design experimental

Acest studiu a fost realizat în conformitate cu recomandările Noțiunilor instructive cu privire la îngrijirea animalelor experimentale, Ministerul Științei și Tehnologiei din China. Protocolul a fost aprobat de Comitetul de Etică al Colegiului de Știință și Tehnologie a Animalelor din cadrul Universității Agricole din China.

Colectarea și măsurarea eșantionului de rum

Extracția ADN-ului microbian, amplificarea PCR, secvențierea iluminării miseq și procesarea datelor secvențiale

tabelul 1

Parametrii de fermentare a rumeniului afectați de creșterea nivelului de concentrat în diete.