Monooxigenază dependentă de flavină, subunitate oxigenază HsaA

Scorul adnotării: 5 din 5

Scorul de adnotare oferă o măsură euristică a conținutului de adnotare al unei intrări sau proteome UniProtKB. Acest scor nu poti să fie utilizat ca o măsură a acurateței adnotării, deoarece nu putem defini „adnotarea corectă” pentru nicio proteină dată.

- Dovezi experimentale la nivel de proteine ​​i

Acest lucru indică tipul de dovezi care susține existența proteinei. Rețineți că dovada „existenței proteinelor” nu oferă informații cu privire la acuratețea sau corectitudinea secvențelor afișate.

Selectați o secțiune din stânga pentru a vedea conținutul.

Această secțiune oferă orice informații utile despre proteine, în principal cunoștințe biologice.

Informații curate manual pentru care există dovezi experimentale publicate.

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Diverse

Această subsecțiune a secțiunii Funcție descrie activitatea catalitică a unei enzime, adică o reacție chimică pe care enzima o catalizează.

Activitatea catalitică i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Această subsecțiune a secțiunii „Funcție” descrie proprietățile biofizice și chimice, cum ar fi absorbția maximă, parametrii cinetici, dependența de pH, potențialele redox și dependența de temperatură.

1. KM = 97 µM pentru 3-HSA (cu FAD la pH 7 și la 25 grade Celsius) 1 Publicație

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Această subsecțiune a secțiunii „Funcție” descrie căile metabolice asociate cu o proteină.

Calea i: biosinteza steroizilor

Site-uri

Această subsecțiune a secțiunii Funcție descrie interacțiunea dintre un singur aminoacid și o altă entitate chimică. Se acordă prioritate adnotării liganzilor fiziologici.

Regiuni

Această subsecțiune a secțiunii Funcție descrie o regiune din proteină care leagă fosfații nucleotidici. Implică întotdeauna mai mult de un aminoacid și include toate reziduurile implicate în legarea nucleotidelor.

Proiectul Gene Ontology (GO) oferă un set de vocabular controlat ierarhic împărțit în 3 categorii:

GO - Funcția moleculară i

• Activitatea 3-hidroxi-9,10-secoandrosta-1,3,5 (10) -triena-9,17-dione monooxigenază Sursa: UniProtKB-EC
• legarea flavinei adenine dinucleotidice Sursa: UniProtKB

Dedus din analiza directă

Folosit pentru a indica o analiză directă pentru funcția, procesul sau componenta indicată de termenul GO.

Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

Dedus din analiza directă i

GO - Proces biologic i

• proces catabolic compus aromatic Sursa: UniProtKB-KW
• proces catabolic al colesterolului Sursa: MTBBASE dedusă din analiza directă i

  Se deduce din fenotipul mutant

  Descrie adnotările care se concluzionează din examinarea variațiilor sau modificărilor unui produs genetic, cum ar fi mutațiile sau nivelurile anormale și include tehnici precum eliminări, supraexpresie, experimente anti-simț și utilizarea inhibitorilor de proteine ​​specifice.

  Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

  Se deduce din fenotipul mutant i

  Cuvintele cheie UniProtKB constituie un vocabular controlat cu o structură ierarhică. Cuvintele cheie rezumă conținutul unei intrări UniProtKB și facilitează căutarea proteinelor de interes.

  Funcția moleculară	Monooxigenaza, Oxidoreductaza
  Proces biologic	Catabolismul hidrocarburilor aromatice, degradarea lipidelor, metabolismul lipidelor, metabolismul steroizilor
  Ligand	FAD, Flavoproteină, FMN

  Baze de date cu enzime și căi

  Colecția BioCyc de baze de date Pathway/Genome

  UniPathway: o resursă pentru explorarea și adnotarea căilor metabolice

  Baze de date chimice

  Resurse de cunoaștere SwissLipids pentru biologia lipidelor

  Această secțiune oferă informații despre numele și sinonimele (proteinele) și genele și despre organismul care este sursa secvenței de proteine.

  Nume și taxonomie i

  Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie oferă o listă exhaustivă a tuturor denumirilor proteinelor, de la cele utilizate în mod obișnuit până la învechire, pentru a permite identificarea fără echivoc a unei proteine.

  Afirmație manuală bazată pe experiment în i

  Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie indică numele (numele) genei care codifică secvența (secvențele) de proteine ​​descrise în intrare. Există patru jetoane distincte: „Nume”, „Sinonime”, „Nume de locus ordonat” și „Nume ORF”.

  Informații curate manual care se bazează pe afirmații din articole științifice pentru care nu există suport experimental.

  Afirmație manuală bazată pe opinie în i

  Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie oferă informații cu privire la numele (numele) organismului care este sursa secvenței de proteine.

  Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie arată identificatorul unic atribuit de NCBI organismului sursă al proteinei. Acesta este cunoscut sub numele de „identificator taxonomic” sau „taxid”.

  Această subsecțiune a secțiunii Numele și taxonomia conține linia de clasificare ierarhică taxonomică a organismului sursă. Acesta listează nodurile așa cum apar de sus în jos în arborele taxonomic, cu gruparea mai generală listată mai întâi.

  Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie este prezentă pentru intrările care fac parte dintr-un proteom, adică a unui set de proteine ​​considerate a fi exprimate de organisme ale căror genomi au fost complet secvențați.

  Un proteom UniProt poate consta din mai multe componente.
  Numele componentei se referă la componenta genomică care codifică un set de proteine.

  Baze de date specifice organismelor

  Baza de date a genomului tulpina H37Rv Mycobacterium tuberculosis

  Această secțiune oferă informații despre localizarea și topologia proteinei mature din celulă.

  Localizarea subcelulară i

  GO - Componenta celulară i

  membrana plasmatică Sursă: MTBBASE Se deduce din testul direct de mare randament i

  Această secțiune descrie modificările post-traducere (PTM) și/sau evenimentele de procesare.

  PTM/Procesare i

  Prelucrarea moleculelor

  Această subsecțiune a secțiunii „PTM/Prelucrare” descrie întinderea unui lanț polipeptidic în proteina matură după procesare sau scindare proteolitică.

  Baze de date proteomice

  PaxDb, o bază de date cu abundența de proteine ​​medii în toate cele trei domenii ale vieții

  Această secțiune oferă informații cu privire la expresia unei gene la nivelul ARNm sau proteine ​​în celule sau în țesuturile organismelor multicelulare.

  Această subsecțiune a secțiunii „Expresie” raportează efectele dovedite experimental ale inductorilor și represorilor (de obicei compuși chimici sau factori de mediu) asupra nivelului de exprimare a proteinelor (sau ARNm) (reglare ascendentă, reglare descendentă, expresie constitutivă).

  Afirmație manuală bazată pe experiment în i

  Această secțiune oferă informații cu privire la structura cuaternară a unei proteine ​​și la interacțiunile cu alte proteine ​​sau complexe proteice.

  Această subsecțiune a secțiunii „Interacțiune” oferă informații despre structura cuaternară a proteinei și interacțiunile cu alte proteine ​​sau complexe proteice (cu excepția interacțiunilor receptor-fiziologic ligand care sunt adnotate în secțiunea „Funcție”).

  Structura subunității i

  Homotetramer în condiții anaerobe. HsaAB monooxigenaza constă dintr-o componentă oxigenază HsaA și o componentă reductază HsaB.

  Afirmație manuală bazată pe experiment în i

  Baze de date de interacțiune proteină-proteină

  STRING: rețele funcționale de asociere a proteinelor

  Această secțiune oferă informații cu privire la structura terțiară și secundară a unei proteine.

  Structura secundară

  Această subsecțiune a secțiunii „Structură” este utilizată pentru a indica pozițiile regiunilor elicoidale determinate experimental în cadrul secvenței proteice.

  Informații validate manual deduse dintr-o combinație de dovezi experimentale și de calcul.

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Această subsecțiune a secțiunii „Structură” este utilizată pentru a indica pozițiile șirurilor beta determinate experimental în secvența de proteine.

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Această subsecțiune a secțiunii „Structură” este utilizată pentru a indica pozițiile virajelor determinate experimental legate de hidrogen în secvența de proteine. Aceste elemente corespund codului de structură secundară DSSP „T”.

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Afirmație manuală dedusă din combinația de dovezi experimentale și de calcul i

  Baze de date cu structură 3D

  Depozitul SWISS-MODEL - o bază de date cu modele de structuri proteice 3D adnotate

  Baza de date a modelelor comparative de structuri proteice

  Banca de date cu proteine ​​în Europa - Baza de cunoștințe

  Această secțiune oferă informații despre asemănările secvenței cu alte proteine ​​și domeniul (domeniile) prezent (e) într-o proteină.

  Familia și domeniile i

  Această subsecțiune a secțiunii „Familia și domeniile” oferă informații despre similaritatea secvenței cu alte proteine.

  Asemănări secvențiale i

  Baze de date filogenomice

  genealogia evolutivă a genelor: grupuri ortologe nesupravegheate

  Identificarea ortologilor din datele complete ale genomului

  Baza de date pentru colecții complete de filogenii genetice

  Baze de date familiale și de domenii

  Adnotarea structurală și funcțională Gene3D a familiilor de proteine

  Resursă integrată de familii de proteine, domenii și site-uri funcționale

  Baza de date a domeniului proteinei Pfam

  Baza de date a superfamiliei de adnotări structurale și funcționale

  Această secțiune afișează în mod implicit secvența canonică de proteine ​​și la cerere toate izoformele descrise în intrare. De asemenea, include informații relevante pentru secvență (e), inclusiv lungimea și greutatea moleculară. Informațiile sunt înregistrate în diferite subsecțiuni. Subsecțiunile actuale și conținutul acestora sunt enumerate mai jos:

  Această subsecțiune a secțiunii Secvență indică dacă secvența canonică afișată implicit în intrare este completă sau nu.

  Starea secvenței i: Complet.

  Suma de control este o formă de verificare a redundanței care este calculată din secvență. Este util pentru urmărirea actualizărilor secvenței.

  Trebuie remarcat faptul că, deși, în teorie, două secvențe diferite ar putea avea aceeași valoare a sumei de control, probabilitatea ca acest lucru să se întâmple este extrem de scăzută.

  Cu toate acestea, UniProtKB poate conține intrări cu secvențe identice în cazul mai multor gene (paralogi).

  Suma de control este calculată ca secvență 64-bit Cyclic Redundancy Check value (CRC64) folosind polinomul generatorului: x 64 + x 4 + x 3 + x + 1. Algoritmul este descris în standardul ISO 3309.

  Presă W.H., Flannery BP, Teukolsky S.A. și Vetterling W.T.
  Redundanță ciclică și alte sume de control
  Rețete numerice în ediția a II-a C, Pp896-902, Cambridge University Press (1993))

  Suma de verificare: și F3103435D8EB1485

  Baze de date secvențiale

  Baza de date a secvențelor de nucleotide EMBL

  Baza de date de secvențe de nucleotide GenBank

  DNA Data Bank din Japonia; o bază de date de secvențe de nucleotide

  Baza de date a secvenței de proteine ​​a resursei de informații privind proteinele

  Secvențe de referință NCBI

  Baze de date de adnotare a genomului

  Ansamblul proiectului de adnotare a genomului bacterian și arheal

  Baza de date a genelor din genomurile NCBI RefSeq

  KEGG: Enciclopedia Kyoto a genelor și genomilor

  Această secțiune oferă legături către proteine ​​similare cu secvența (secvențele) de proteine ​​descrise în această intrare la diferite niveluri ale pragurilor de identitate a secvenței (100%, 90% și 50%) pe baza apartenenței lor la clusterele de referință UniProt (UniRef).

  Proteine ​​similare i

  Această secțiune este utilizată pentru a indica informații legate de intrări și găsite în colecții de date, altele decât UniProtKB.

  Baze de date secvențiale

  Baze de date cu structură 3D

  Protein Data Bank Europe

  Protein Data Bank RCSB

  Protein Data Bank Japonia

  Baze de date de interacțiune proteină-proteină

  Baze de date chimice

  Baze de date proteomice

  Baze de date de adnotare a genomului

  Baze de date specifice organismelor

  Baze de date filogenomice

  Baze de date cu enzime și căi

  Baze de date familiale și de domenii

  ProtoNet; Clasificarea ierarhică automată a proteinelor

  MobiDB: o bază de date cu tulburări de proteine ​​și adnotări de mobilitate

  Această secțiune oferă informații generale despre intrare.

  Informații de intrare i

  Această subsecțiune a secțiunii „Informații despre intrare” oferă un identificator mnemonic pentru o intrare UniProtKB, dar nu este un identificator stabil. Fiecărei intrări revizuite i se atribuie un nume de intrare unic la integrarea în UniProtKB/Swiss-Prot.

  Această subsecțiune a secțiunii „Informații de intrare” furnizează unul sau mai multe numere de acces. Aceștia sunt identificatori stabili și ar trebui folosiți pentru a citi intrările UniProtKB. După integrarea în UniProtKB, fiecărei intrări i se atribuie un număr unic de accesare, numit „număr de accesare primar (citabil)”.

  Această subsecțiune a secțiunii „Informații despre intrare” arată data integrării intrării în UniProtKB, data ultimei actualizări a secvenței și data ultimei modificări de adnotare („Ultima modificare”). De asemenea, sunt afișate numărul versiunii atât pentru intrare, cât și pentru secvența canonică.

  Această subsecțiune a secțiunii „Informații despre intrare” indică dacă intrarea a fost adnotată manual și revizuită de curatorii UniProtKB sau nu, cu alte cuvinte, dacă intrarea aparține secțiunii Swiss-Prot din UniProtKB (revizuit) sau la secțiunea TrEMBL adnotată de computer (nerecomandat).

  Această secțiune conține orice informații relevante care nu se încadrează în alte secțiuni definite

  Cuvinte cheie - Termen tehnic i

  Documente

  1. Comentarii PATHWAY
     Indicele căilor metabolice și de biosinteză
  2. Referințe încrucișate PDB
     Indexul referințelor încrucișate ale Protein Data Bank (PDB)
  3. SIMILARITATE comentarii
     Indexul domeniilor și familiilor de proteine

  Instrumente

  Date de bază

  Date suport

  • Citări de literatură
  • Taxonomie
  • Cuvinte cheie
  • Locații subcelulare
  • Baze de date cu referințe încrucișate
  • Boli

  informație

  • Despre UniProt
  • Ajutor
  • FAQ
  • Manual UniProtKB
  • Colț tehnic
  • Biocurarea expertă

  UniProt este o resursă de bază ELIXIR

  Dorim să vă informăm că ne-am actualizat Notificarea de confidențialitate pentru a respecta noul Regulament general privind protecția datelor (GDPR) din Europa care se aplică începând cu 25 mai 2018.

  • Metro Health confirmă cazul de tuberculoză la Johnson High School
  • Tulpina lombară Johns Hopkins Medicină
  • Simptomele, testele și tratamentul tulpinii musculare
  • Tulpina lombară Cedri-Sinai
  • Tratament imediat pentru o tulpină musculară a spatelui