scurta descriere

Descărcați Curriculum Vitae Prof. dr. ir. Edwin P.J.G. Cuppen.

curriculum

Descriere

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae Prof. dr. ir. Edwin P.J.G. Cuppen

Activitate curentă - profesor de genetică umană și director al Centrului de Medicină Moleculară, Centrul Medical Universitar Utrecht, Olanda. - Co-fondator și membru al comitetului de conducere al Centrului Olandez pentru Tratamentul Personalizat al Cancerului, o colaborare națională care vizează stratificarea pacienților cu cancer către tratamente specifice bazate pe măsurători ADN ale tumorii metastazate. - Director Hartwig Medical Foundation, care se concentrează pe furnizarea la scară populației a secvențierii genomului medical întreg și colectarea și integrarea datelor clinice pentru îmbunătățirea îngrijirii pacienților. - Expert în secvențierea genomului întreg al sistemelor model și al pacienților (boli congenitale, cancer), biologie integrativă (genomică, transcriptomică, proteomică, date despre pacienți) și cercetări translaționale. Abordare:

Telefon: E-mail: Web: Social Media:

Centre for Molecular Medicine, University Medical Center Utrecht Universiteitsweg 100 3584 GG Utrecht, Olanda +31 88 75 50701 (secretar +31 88 75 68312) [e-mail protejat] http://www.hubrecht.eu/research/cuppen, http: //www.umcutrecht.nl/genetics Twitter: @ecuppen, LinkedIn: nl.linkedin.com/pub/edwin-cuppen/46/2b8/a50

Profil Edwin Cuppen (1970) și-a obținut masteratul în științe moleculare la Universitatea Agricolă Wageningen în 1994 (cum laude) și doctoratul în 1999 la Universitatea Radboud din Nijmegen în grupul Prof. Fii Wieringa. În timpul educației, a petrecut o jumătate de an în laboratorul Jaenish de la Whitehead Institute din Boston. Din 1999 până în 2002 a efectuat cercetări postdoctorale la Institutul Olandez pentru Cancer din Amsterdam și la Institutul Hubrecht din Utrecht, Olanda, în grupul Prof. Ronald Plasterk. În 2002 a devenit om de știință la Institutul Hubrecht, iar în 2007 a fost numit profesor de biologie genomică la Departamentul de biologie al Universității Utrecht. În 2009 a fost numit profesor de genetică umană și șef al secției de cercetare a departamentului de genetică medicală al Centrului Medical Universitar din Utrecht, în timp ce își continua activitatea la Institutul Hubrecht cu o programare pe două părți. În 2015,

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Educație 1995 - 1998 1988 - 1994

Doctor la Universitatea din Nijmegen, Facultatea de Științe Medicale, Departamentul de Biologie Celulară și Histologie MSc Cum Laude la Universitatea Agricolă din Wageningen, Științe moleculare, orientare chimico-biologică

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Premii - Premiul European Young Investigators (EURYI) 2005 (1,2 milioane EUR, European Science Foundation). - Grantul NWO Vici 2013 (1,5 M €)

Activități de consultanță academică - 2015: Comitetul de evaluare al departamentului Institutul Flemisch pentru Biotehnologie (VIB) - 2013 - prezent: membru „wetenschappelijke raad KiKa” (fundația consiliului științific Children Cancer Free) - 2012 - 2014: membru al grupului de experți Academia finlandeză de științe - 2010 - prezent: Consiliul consultativ Liverpool Centre for Genomic Research - 2010 - 2015: Advisory Board Knockout Rat Consortium - 2009 - 2012: membru FWO expert panel, Belgia - 2007/2008: Membru Scientific Advisory Board ELSYS (Young European Scientists in Life Science) - 2008: Comitetul științific vizitat site-ul CGM, Paris, Franța - 2007: Comitetul expert al revistei FP6 - 2005: Comitetul științific membru al vizitei site-ului Institutul Roslin, Edinburg, Marea Britanie - Recenzorul pentru diferite reviste, inclusiv cercetarea acizilor nucleici, genomică, bioinformatică, BMC genomică, BMC Bioinformatică, Bioinformatică, Biologia genomului, Cercetarea genomului, PNAS, Genetica naturii, Natura, Metodele naturii, Celula. - Evaluator și membru al comitetului pentru diferite agenții de finanțare naționale și internaționale (NWO, KWF, KiKa, BBSRC, Wellcome Trust, CR-UK, CNRS)

Activități de consultanță comercială - 2014 - prezent: Consilier științific BlueBee (genomică de accelerare hardware) - 2013 - prezent: Consilier științific Elly Lilly (genomică șobolan) - 2012 - prezent: Comitet consultativ științific Cergentis BV (tehnologie de secvențiere țintită) - 2012 - prezent: Comitetul consultativ științific Genalice (analiză de date cu volum mare) - 2008 - 2012: Consilier științific Philips Research (tehnologia analizei ADN) - 2006 - prezent: Comitetul consultativ științific InteRNA Technologies BV (terapie bazată pe miRNA)

Alte activități științifice naționale și internaționale - 2013: Comitetul științific A doua conferință internațională de genomică, Ghent, Belgia - 2013: Comitetul de program al președintelui Federa Dag Secvențierea generației următoare 2013 - 2007 - 2014: organizator Reuniunea anuală Spring Spring Harbor/Wellcome Trust „Rat genomics și modele '- 2010 - prezent: membru al Comitetului de coordonare Centrul pentru tratamentul personalizat al cancerului (www.CPCT.nl) - 2010 - 2015: membru al Comitetului de direcție Programul FP7 al UE EURATRANS (www.euratrans.eu) - 2012 - 2014: mentor Steyn Parve program de coaching UMC Utrecht

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

- 2011 - 2013: Director Centrul Olandez pentru Diagnosticul Genomului (CGD) - 2008 - 2012: Reuniunea anuală a organizatorilor olandezi de secvențiere de generație următoare - 2009 - 2012: Juriul președintelui Programul de onoruri X-track - 2010: Co-organizator primul european (FSE) reuniune de secvențiere de generație următoare - 2007 - 2009: comitet membru al programului NWO Computational Life Sciences II.

Publicații științifice 183 de articole, 11 capitole de cărți Numărul total de citate: 7.618 H-index este 46 (sursa Scopus, 4-10-2015) factor mediu de impact: 10,1 (factori IF 2013), 58 lucrări (32%) cu factor de impact> 10 prim/ultim autor pe 47% din articole, colaborare internațională pentru 33% din articole 6 brevete (cereri) ID cercetător (www.researcherid.com): F-5696-2011

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

Cărți sau contribuții la cărți -

Weijzen, S., Schaapveld, R., Bourajjaj, M., van Haastert, R., Griffioen, A., van Beijnum, J., Cuppen, E., Berezikov, E., van Puijenbroek, A., Gommans, W., Negar, B., (2011). Mir-190b pentru tratarea neoangiogenezei. Cererea SUA nr. 61/521.917 și 61/522.346 Weijzen, S., Schaapveld, R., Bourajjaj, M., van Haastert, R., Griffioen, A., van Beijnum, J., Cuppen, E., Berezikov, E ., van Puijenbroek, A., Gommans, W., van Noort, P., Negar, B., (2011). Mir-142 pentru tratarea neoangiogenezei. Cererea SUA nr. 61/521.931 Weijzen, S., Schaapveld, R., Bouraijaj, M., van Haastert, R., Griffioen, A., van Beijnum, J., Cuppen, E., Berezikov, E., van Puijenbroek, A., Gommans, W. (2011). Mir pentru tratarea neo-angiogenezei. EPC: 11150645.7-1212 van Boxtel, R. și Cuppen, E. (2007). Animale din genul rattus unde expresia msh6 este funcțional scăzută și metode pentru generarea de mutanți specifici de acolo. WO2009072882 Cuppen, E., Meijer, G., Berezikov, E., Diosdado, B., (2007). Molecule mici de ARN, precursori ai acestora, mijloace și metode de detectare a acestora și utilizări ale acestora la tiparea probelor. WO2009008720 Berezikov, E., Cuppen, E., Plasterk, R. (2006). Molecule de acid nucleic și colecțiile acestora, aplicarea și modificarea acestora. WO2007081204

Software-ul public și bazele de date dezvoltate în laboratorul meu -

Tagbrowser (http://genetics.genomicscenter.nl/tagbrowser/), nepublicat: Browser pentru vizualizarea la nivel mulit a datelor brute NGS LIMSTILL (http://limstill.niob.knaw.nl), nepublicat: Laboratory Information Management System ( LIMS) pentru identificarea mutațiilor și SNP-urilor prin secvențiere și TILling CASCAD (http://cascad.niob.knaw.nl) (Guryev și colab., 2004, Genome Res. 14: 1438-1443; Guryev și colab., 2005, BMC Genomics 6 (1): 10): Baza de date SNP candidat pentru șobolan și pește zebră CONREAL (http://conreal.niob.knaw.nl) (Berezikov și colab., 2004, Genome Res. 14: 170-178; Berezikov et al., 2005, Nucl. Acid Res. 33: W447-W450): Instrument pentru identificarea elementelor de reglare conservate în regiunile promotoare GENOTRACE (http://genotrace.niob.knaw.nl) (Berezikov și colab., 2002, Bioinformatics 18: 1396-1397): Instrument de asamblare a genomului local utilizând date brute de urmărire din proiecte de secvențiere a întregului genom

Curriculum Vitae, octombrie 2015

Prof. dr. ir. E.P.J.G. Cuppen

NWO Vici (2014-2019): Variația structurală disecantă KWF Stand up to cancer (2013-2017): Cancer organoid genomics NWO Zwaartekracht (2013-2022): Cancer Genomics Netherlands NGI Zenith (2012-2016): Integritatea genetică a celulelor stem adulte Center for Genome Diagnostics (CGD), Netherlands Genomics Initiative (2011-2013): Următoarea generație de secvențializare în diagnosticare Center for Personalized Cancer Treatment (CPCT), KWF/Alpe d'huzes (2011) NWO TOP-CW (2009 - actual): Genomica șobolanilor EU FP7 EURATRANS (2010-curent): Genetica sistemelor de șobolani EU FP7 ZFHEALTH (2010-curent): Zebrafish genetics NBIC (NGI) BioRange-2 și BioAssist (2010 - 2013): Următoarea generație de analiză a secvențierii datelor CGC-2 (NGI) (2009-2013): Genetica cancerului Rețea transatlantică Leducq (2009): miRNA în inimă Consorțiul SMARTMIX (EZ și OCW) (2008 - curent): Modele knockout Zebrafish NCSB (NGI) (2008 - 2013): Genetica sistemelor de cancer NBIC (NGI) Biorange-1 (2006-2009): Analiza bioinformatică pentru analiza mutațiilor EU FP6 ZFMODELS (2004-2009): Modele knockout pește zebră NWO groot (2005): Descoperire mutație cu randament ridicat Genetica IOP (2002-2007): Genetica inversă a șobolanilor