↵ 1 Acești autori au contribuit în mod egal la această lucrare.

suprafeței

Editat de Wolfgang Peti

Abstract

Tk-hefu este o peptidă artificială concepută pe baza eșafodului α-hairpinin, care blochează selectiv canalele de potasiu cu tensiune Kv1.3. Aici vă prezentăm structura spațială rezolvată prin spectroscopie RMN și analizăm interacțiunea cu canalele folosind modelarea computerizată. Aplicăm topografia suprafeței proteinelor pentru a sugera mutații și pentru a crește afinitatea Tk-hefu la izoforma canalului Kv1.3. Proiectăm suprafața funcțională a Tk-hefu pentru a se potrivi mai bine cu suprafața respectivă a vestibulului porilor canalului. Peptida rezultată Tk-hefu-2 păstrează selectivitatea Kv1.3 și afișează o activitate de aproximativ 15 ori mai mare comparativ cu Tk-hefu. Verificăm modul de legare Tk-hefu-2 la canalul vestibul exterior experimental prin mutageneză direcționată către sit. Susținem că ingineria schelelor ajutată de topografia suprafeței proteinelor reprezintă un instrument fiabil pentru proiectarea și optimizarea liganzilor specifici ai canalelor ionice.

  • canal ionic
  • dinamica moleculara
  • neurotoxină
  • rezonanță magnetică nucleară (RMN)
  • peptide
  • canal de potasiu
  • motiv proteic
  • structura proteinelor
  • alfa-hairpinin
  • hefutoxină
  • blocant de pori

Note de subsol

Această lucrare a fost susținută de subvenții din cadrul programului de biologie moleculară și celulară al Academiei de Științe din Rusia (către AAV și AOC), proiectul de excelență academică rusă „5–100” și programul de cercetare de bază de la Școala Superioară de Economie a Universității Naționale de Cercetare ( la RGE, AOC și NAK), FWO Flanders Grants GOC2319N și GOA4919N și CELSA/17/047 (BOF, KU Leuven) (către J. T.) și KU Leuven Grant PDM/19/164 (către S. P.). Autorii declară că nu au conflicte de interese cu conținutul acestui articol .

Acest articol conține Fig. S1 - S3.

Coordonatele atomice și factorii de structură (cod 5LM0) au fost depuși în Protein Data Bank (http://wwpdb.org/).

Publicat sub licență exclusivă de Societatea Americană pentru Biochimie și Biologie Moleculară, Inc.