Catherine A.M. Graham

genetici

Facultatea de Științe ale Sănătății și Vieții

Universitatea Oxford Brookes

Headington Road, Oxford OX3 0BP (Marea Britanie)

Articole similare pentru „”

  • Facebook
  • Stare de nervozitate
  • LinkedIn
  • E-mail

Abstract

Introducere

Multe SNP-uri au fost identificate ca fiind asociate fără echivoc cu trăsături legate de obezitate, dintre care puțin se știe dincolo de asociere [5, 6]. SNP-urile singure nu au fost raportate ca echivalând cu valoarea predictivă clinică [5]; totuși, când în combinație cu factorii L&SD, puterea predictivă atinge semnificație [6, 7, 10, 11]. Cea mai puternică putere predictivă a fost raportată recent de Khera și colab. [6], utilizând o abordare bayesiană utilizând peste 2 milioane de SNP-uri. Studiile fie prezic starea greutății în momentul colectării datelor (transversal) [6, 10], fie prezic longitudinal starea greutății viitoare [11, 12].

Asociațiile, cauzele și tendințele de supraponderalitate și obezitate diferă între țări și, în general, țările mai occidentalizate au cea mai mare prevalență [13]. Prin urmare, ne-am propus să identificăm proporția excesului de greutate care poate fi explicată prin factori de risc genetici parentali cunoscuți și factori de risc L&SD numai cu statutul de greutate descendenți într-o cohortă din Marea Britanie.

Materiale și metode

A fost realizat un studiu transversal. Participanților li se cerea să fie părintele biologic al unui copil cu vârsta de până la 16 ani, să fie îngrijitorul lor primar, născut și care trăiește în prezent în Marea Britanie, să nu aibă vreo boală cronică (cu excepția supraponderalității și obezității) și să nu urmeze o greutate program de pierdere. Un calcul al puterii pentru numărul de variabile incluse în analiza de regresie [14, 15] cu mărimea anticipată a efectului mediu (f 2) de 0,18, un nivel de putere statistic dorit de 0,8, un nivel de probabilitate de 0,05 și 18 predictori au concluzionat că Au fost necesari 127 de participanți [15, 16]. S-a contabilizat uzarea de 5%, încercând să recruteze 133 de participanți. Au fost recrutați în total 130 de părinți, dintre care 3 s-au retras înainte de analiza genetică, iar alți 4 nu au furnizat seturi complete de date și, prin urmare, au fost excluși. Au fost colectate date complete L&SD și SNP pentru 123 de părinți, rezultând o putere estimată de 0,78.

Măsurători antropometrice pentru părinți și copii

Datele despre părinți și despre descendenți au fost raportate de unul sau de ambii părinți. Înălțimea (m) și greutatea (kg) au fost colectate pentru unul sau ambii părinți și descendenți. S-a colectat și greutatea maternă înainte de sarcină. IMC a fost calculat pentru mamă (curent și pre-sarcină) și/sau tată (curent) folosind ecuația: greutate (kg)/înălțime (m) 2 [1]. Participanții adulți au fost clasificați în grupuri cu greutate normală și supraponderal pe baza criteriilor Organizației Mondiale a Sănătății (OMS) (≥25 kg/m 2) [1]. Percentila în greutate a copilăriei a fost calculată utilizând criteriile OMS și UK90 [17, 18]. Copiii cu vârsta cuprinsă între 0 și 16 ani au fost clasificați în grupuri cu greutate normală și supraponderal (copii cu vârsta între 0 și 2 ani ≥85 percentilă, copii cu vârsta între 2-16 ani ≥98 percentilă) [17, 18].

Variabile L&SD parentale

Toate variabilele au fost raportate de către părinte. Datele au fost colectate utilizând platforma Bristol Online Survey (https://www.onlinesurveys.ac.uk/). Următorii factori de risc L&SD parentali utilizați în studiul de Morandi și colab. [7] au fost evaluate dihotomic: sex (bărbat/femeie), monoparentalitate (da/nu) și statutul de fumat (da/nu). Următoarele variabile au fost selectate a priori, în funcție de asocierea lor cu obezitatea în Marea Britanie [19]: statutul gospodăriei (fie că este proprietate privată), venitul (peste/sub 32.000 GBP - rata de bază a impozitului 2016) [20], ore de somn per noapte (peste/sub 7 ore pe noapte), indiferent dacă a obținut studii superioare (da/nu), dacă a fost alăptat (da/nu), metoda nașterii copilului (secțiune naturală sau cezariană) și etnie (indiferent dacă este caucazian sau nu).

Analiza genetică

Următorii SNP au fost aleși pentru includerea finală: factor neurotrofic derivat din creier (BDNF) genă rs6265 (dimensiunile efectului adulți/copii: 0,19/0,19), FTO rs9939609 (0,38/0,39), receptorul melanocortinei 4 (MC4R) genă rs17782313 (0,07/0,13), proteină transmembranară 18 (TMEM18) genă rs2867125 (0,31/0,31) și serină/treonină-protein kinază (TNN13K) genă rs1514175 (0,07/0,07).

Următorul proces de selecție a SNP a fost efectuat: în primul rând, SNP-urilor li s-a cerut să fie asociate cu obezitatea copilăriei și a vârstei adulte în mod independent în studiile de asociere la nivel de genom cu o mărime definită a efectului (raportate mai sus) [21-24]. Aceasta a fost pentru a asigura o evaluare a evoluției obezității pe parcursul vieții. SNP-urile au fost excluse dacă au fost asociate doar cu vârsta adultă sau cu obezitatea infantilă, dar nu și ambele. Au fost incluși SNP-urile cu cea mai mare dimensiune definită a efectului atât pentru obezitatea copilăriei, cât și pentru cea adultă. Acestea au fost, de asemenea, clasate în consorțiul GIANT ca având unele dintre cele mai puternice asociații cu obezitatea [25]. Ulterior, dintre SNP-urile selectate, plauzibilitatea biologică a fost evaluată de echipa de cercetare. Pentru ca plauzibilitatea biologică să fie aprobată, SNP a trebuit să aibă un mecanism sugerat care să indice reglarea greutății corporale. Următoarele gene și SNP au îndeplinit criteriile de includere și, prin urmare, au fost incluse în prezentul studiu: BDNF rs6265 [26], FTO rs9939609 [27], MC4R rs17782313 [28], TMEM18 rs2867125 [29] și TNN13K rs1514175 [30]. Scopul acestui studiu a permis includerea primilor 5 SNP-uri după procesul de selecție menționat mai sus.

Probele de salivă (2 ml) au fost colectate pentru analize ADN de la părinți (GeneFiX; Isohelix, Kent, Marea Britanie). Extracția ADN a fost efectuată prin utilizarea unui kit ADN PSP® SalivaGene 17 ADN 1011 (STRATEC Molecular, Berlin). Cuantificarea ADN și controlul calității au fost evaluate prin spectroscopie (Nanodrop; ThermoFisher, Waltham, MA, SUA). Genotiparea a fost efectuată folosind teste de genotipare TaqMan® SNP pregătite pentru rs6265, rs9939609, rs17782313, rs2867125, și rs1514175 (ThermoFisher) și termociclatorul StepOnePlus (Applied Biosystems, CA, SUA). Toate probele au fost analizate în duplicat în conformitate cu protocolul producătorului. Probele individuale au fost acceptate cu o calitate de peste 98%. Toate analizele genetice au fost efectuate la St. Mary’s University, Twickenham.

Analize statistice

Analiza regresiei

În primul rând, regresia logistică (n = 123 de părinți) au stabilit că doar IMC matern a fost semnificativ, deși modest, asociat cu statutul de greutate al descendenților (p = 0,015; ajustat R 2 = 0,15).

Analiza exploratorie: factorii genetici și L&SD parentali și starea greutății copilului

Un procent mai mare de mame ale copiilor supraponderali (n = 16) a purtat MC4R rs17782313 alele cu risc mai mare (C) (77,8%) comparativ cu mamele copiilor cu greutate normalăn = 60) (41,4%; p = 0,007; χ 2 = 7.208) (Fig. 1). Când a fost controlat pentru categoria greutății mame, rezultatele generale au rămas semnificative (p = 0,006; χ 2 = 7.666). Un procent mai mare de mame neponderale ale copiilor supraponderali (n = 11) a purtat MC4R rs17782313 alele cu risc mai mare (C) (84,6%) comparativ cu mamele copiilor cu greutate normalăn = 22) (42,3%; p = 0,006; χ 2 = 7.448). Nu s-a observat nicio semnificație între procentul de mame supraponderale și categoria de greutate a descendenților (p > 0,05). Nu au fost găsite alte asociații genetice printre SNP-urile selectate pentru acest studiu (datele nu sunt prezentate).

FIG. 1.

Genotipul matern și starea greutății descendenților. Valorile cu un asterisc indică o diferență semnificativă (p 2 = 5,012). La controlul pentru categoria greutății tatălui, rezultatele generale au rămas semnificative (p = 0,039; χ 2 = 5,012). Un procent mai mare de tați non-caucazieni supraponderali (n = 4) au avut un procent mai mare de copii supraponderali (80%) decât tații caucazieni supraponderalin = 1) (20%; p = 0,039; χ 2 = 5,012). Nu s-a observat nicio semnificație între procentul de tați non-caucazieni neponderali și categoria de greutate a descendenților (p > 0,05).

Un procent mai mare de părinți care au dormit mai puțin de 7 ore pe noapte (n = 66) au avut copii supraponderali (38,6%) comparativ cu cei care au dormit mai mult de 7 ore pe noapten = 57) (13,6%; p = 0,014; χ 2 = 7.122). Atunci când se controlează categoria de greutate mamă, rezultatele generale au rămas semnificative (p = 0,025; χ 2 = 5.0.49). Un procent mai mare de mame neponderale ale descendenților ai căror părinți au dormit mai puțin de 7 ore pe noapte (n = 10) au avut copii supraponderali (76,9%), comparativ cu mame neponderale ale descendenților ai căror părinți au dormit mai mult de 7 ore pe noapte (n = 3)p = 0,005; χ 2 = 7.814). Nu s-a observat nicio semnificație între procentul de mame supraponderale ale descendenților ai căror părinți dormeau mai puțin de 7 ore pe noapte și mame supraponderale ale descendenților ai căror părinți dormeau mai mult de 7 ore pe noapte (p > 0,05). Setul de date a fost prea mic pentru a controla statutul de greutate a tatălui. Toate datele L&SD pot fi găsite în tabelele 1 și 2. Nu au fost găsite alte asociații L&SD (datele nu sunt prezentate).

Discuţie

Acest studiu a avut ca scop identificarea proporției excesului de greutate care poate fi explicată prin factori genetici genetici cunoscuți și factori de risc L&SD cu status de greutate descendenți. Am demonstrat că doar IMC matern a prezis în mod semnificativ, deși modest, starea ponderală a descendenților (reprezentând o proporție de 15%); genetica nu a contribuit. Analiza exploratorie a furnizat următoarele rezultate generatoare de ipoteze: maternă MC4R Alela de risc rs17782313 (C) este asociată cu supraponderalitatea descendenților, împreună cu IMC matern, etnia paternă și durata somnului părintesc. Acesta este singurul studiu realizat până în prezent care evaluează dacă L&SD parental cunoscut și factorii de risc genetici sunt asociați cu starea ponderală a descendenților într-o cohortă din Marea Britanie, în lumina prevenirii obezității.

Pentru a confirma dacă asocierea a găsit între matern MC4R Rs17782313 alele de risc și starea greutății descendenților a fost independentă de asocierea găsită între starea greutății materne și descendenți, starea greutății materne a fost controlată în analiza exploratorie. În ciuda limitării dimensiunii eșantionului discutată mai jos, rezultatele au rămas semnificative, în special în cadrul cohortei materne neponderale. Demonstrând că atunci când L&SD puternic, cum ar fi starea greutății materne [37], nu sunt evidente, predispoziția genetică poate juca un rol în dezvoltarea obezității [6]. Astfel de informații pot contribui la îngrijirea personală preventivă a sănătății. Deși aici a fost raportată o asociație în cadrul analizei exploratorii, este important să continuați această cercetare preliminară pentru a trage concluzii mai puternice. Până în prezent, rezultatele au fost neconcludente în ceea ce privește contribuția factorilor genetici la creșterea în greutate. Inițial, studiile au demonstrat că L&SD oferă o contribuție mai mare la rezultatul în greutate [5, 7]. Cu toate acestea, mai recent, sa raportat că contribuția genetică este un factor important care contribuie [6, 10].

În studiul actual a fost observată o asociere între durata somnului părintesc și starea de greutate a descendenților. Acest lucru este în concordanță cu alte cercetări [43, 44]. De exemplu, Cappuccio și colab. [43] (2008) în meta-analiza lor au raportat că la copii ponderea cotelor pentru durata scurtă de somn și obezitate a fost de 1,89 (1,46-2,43; p