Afilieri

  • 1 Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, CB10 1SA, Marea Britanie.
  • 2 Institutul Gurdon și Departamentul de Genetică, Universitatea Cambridge, Cambridge, CB2 1QN, Marea Britanie.
  • 3 Școala de Științe Biologice, Universitatea Bangor, Bangor, Gwynedd, LL57 2UW, Marea Britanie.
  • 4 Departamentul de Studii Evolutive ale Biosistemelor, SOKENDAI, Kanagawa 240-0193, Japonia.
  • 5 Institutul de cercetare în domeniul pescuitului din Tanzania, caseta 9750, Dar es Salaam, Tanzania.
  • 6 Școala de Științe Biologice, Clădirea Științelor Vieții, 24 Tyndall Avenue, Universitatea din Bristol, Bristol, BS8 1TQ, Marea Britanie.

  • PMID: 26680190
  • PMCID: PMC4700518
  • DOI: 10.1126/science.aac9927
Articol PMC gratuit

Autori

Afilieri

  • 1 Wellcome Trust Sanger Institute, Cambridge, CB10 1SA, Marea Britanie.
  • 2 Institutul Gurdon și Departamentul de Genetică, Universitatea Cambridge, Cambridge, CB2 1QN, Marea Britanie.
  • 3 Școala de Științe Biologice, Universitatea Bangor, Bangor, Gwynedd, LL57 2UW, Marea Britanie.
  • 4 Departamentul de Studii Evolutive ale Biosistemelor, SOKENDAI, Kanagawa 240-0193, Japonia.
  • 5 Institutul de cercetare în domeniul pescuitului din Tanzania, caseta 9750, Dar es Salaam, Tanzania.
  • 6 Școala de Științe Biologice, Clădirea Științelor Vieții, 24 Tyndall Avenue, Universitatea din Bristol, Bristol, BS8 1TQ, Marea Britanie.

Abstract

Cauzele și efectele genomice ale selecției ecologice divergente în timpul speciației sunt încă slab înțelese. Aici raportăm descoperirea și caracterizarea detaliată a divergenței adaptive în stadiu incipient a două ecomorfe de pești ciclide într-un lac crater izolat (700 de metri în diametru) din Tanzania. Ecomorfele diferă în ceea ce privește preferința de profunzime, culoarea reproducerii masculine, forma corpului, dieta și morfologia trofică. Cu secvențe de genom întreg de 146 de pești, am identificat 98 de „insule” genomice clar delimitate și de mare diferențiere și am demonstrat asocierea genotipurilor de pe aceste insule cu preferințe de partener divergente. Insulele conțin gene adaptive candidate îmbogățite pentru funcții în percepția senzorială (inclusiv rodopsina și alte gene asociate crepuscularii), semnalizarea hormonală și morfogeneza. Studiul nostru sugerează mecanisme și regiuni genomice care pot juca un rol în mega-radiația strâns legată a lacului Malawi.

speciație

Cifre

FIG. 1. Radiația ciclidelor din crater ...

FIG. 1. Radiații ciclide în lacurile craterului din sudul Tanzaniei

FIG. 2. Datele secvenței genomului întreg

FIG. 2. Datele secvenței genomului întreg

FIG. 3. Insule de speciație între bentice ...

FIG. 3. Insule de speciație între ecomorfe bentice și litorale

FIG. 4. Încercări la alegere

FIG. 4. Încercări la alegere

FIG. 5. Funcția caracteristică a genelor în ...

FIG. 5. Funcția caracteristică a genelor în HDR