Se arată că starea actuală a genomului Pichia pastoris lipsește adnotări funcționale extinse.

îmbunătățirea

Transferul de adnotări GO și conductele de curățare a literaturii îmbunătățesc adnotarea funcțională a genomilor.

Conductele și instrumentele care pot îmbunătăți starea de adnotare a genomului Pichia pastoris și a multor microbi industriali sunt considerate.

Secvențe de genom bine adnotate vor facilita utilizarea acestor microbi într-o gamă mai largă de aplicații de biologie sintetică.

Comunitățile de cercetare care studiază organismele model microbiene, cum ar fi Escherichia coli sau Saccharomyces cerevisiae, sunt bine deservite de bazele de date ale organismelor model care au adnotări funcționale extinse. Cu toate acestea, acest lucru nu este adevărat pentru mulți microbi industriali care sunt utilizați pe scară largă în biotehnologie. În această piesă de opinie, folosim Pichia (Komagataella) pastoris pentru a ilustra limitările adnotării disponibile. Luăm în considerare resursele care pot fi implementate pe termen scurt atât pentru a îmbunătăți acoperirea adnotării Gene Ontology (GO) pe baza transferului de adnotări, cât și pentru a stabili conducte de curățenie pentru corpusul de literatură al acestui organism.

Anterior articolul emis Următorul articolul emis