Flux de lucru pentru căutarea și analiza grupurilor de coexpresie pentru gena Gagr și gene cu expresie indusă de virus. DEG - gene exprimate diferit; TFBS - site-uri de legare a factorului de transcripție.

Clustere de coexpresie de gene cu expresie indusă de virus (conform GEO: GSE2828, GSE31542, GSE42255). Genele din grupul cu Gagr (grupul 2) sunt marcate în verde, gena Gagr este marcată cu roșu.

Analiza regiunilor promotor ale genei Gagr și a ortologilor săi. (A) Localizarea siturilor de legare pentru factorii de transcripție Dif, kay și Stat92E în promotorul genei Gagr. (B) Filogramă bazată pe secvențele promotor ale genei Drosophila Gagr; sunt prezentate valorile ramurilor bootstrap (numărul de replici bootstrap este 1000).

Alinierea regiunilor promotor Gagr pentru diferite specii de Drosophila. Caracteristici marcate în culori: TFBS - Site-uri de legare a factorului de transcripție; Dme_TSS_and_5’-UTR - site-ul de început al transcrierii și regiunea 5’-untraslated a D. melanogaster Gagr; ORF - Deschideți cadrul de citire.

Abstract

domesticite

Flux de lucru pentru căutarea și analiza grupurilor de coexpresie pentru gena Gagr și gene cu expresie indusă de virus. DEG - gene exprimate diferit; TFBS - site-uri de legare a factorului de transcripție.

Clustere de coexpresie de gene cu expresie indusă de virus (conform GEO: GSE2828, GSE31542, GSE42255). Genele din grupul cu Gagr (grupul 2) sunt marcate în verde, gena Gagr este marcată cu roșu.

Analiza regiunilor promotor ale genei Gagr și a ortologilor săi. (A) Localizarea siturilor de legare pentru factorii de transcripție Dif, kay și Stat92E în promotorul genei Gagr. (B) Filogramă bazată pe secvențele promotor ale genei Drosophila Gagr; sunt prezentate valorile ramurilor bootstrap (numărul de replici bootstrap este 1000).

Alinierea regiunilor promotor Gagr pentru diferite specii de Drosophila. Caracteristici marcate în culori: TFBS - Site-uri de legare a factorului de transcripție; Dme_TSS_and_5’-UTR - site-ul de început al transcrierii și regiunea 5’-untraslated a D. melanogaster Gagr; ORF - Deschideți cadrul de citire.