De Physilia Chua

unui

Pestriţ! Un mic cocoș care își prezintă magnificele pene de coadă

CREDIT FOTOGRAFIC: Per Gätzschmann

O dată sunt zilele în care cercetătorii au avut nevoie să petreacă nenumărate ore observând un animal în sălbăticie pentru a-i înțelege comportamentul și ecologia. După cum demonstrăm cu studiul nostru, date valoroase pot fi colectate prin simpla examinare a probelor fecale cu abordări puternice de metagenomică.

Nevoia de date care informează în mod eficient conservarea biologică se intensifică pe măsură ce rata pierderii biodiversității crește. În mod tradițional, oamenii de știință au suportat ore lungi pe câmp, ascunzându-se adesea inconfortabil în tufișuri sau străbătând locuri periculoase și greu accesibile, totul în scopul observării animalelor evazive.

Căutând cocoși în mijlocul unei furtuni de zăpadă în pădurile boreale norvegiene

Odată cu apariția
"> Tehnologiile de secvențiere de generație următoare (NGS) - cele care furnizează în mod eficient cantități mari de date de secvență ADN - este acum posibil să se obțină o bogăție de informații ecologice dintr-un singur eșantion fecal. Ușurința de colectare a acestor probe eludează unele dintre provocări de a studia animalele altfel greu de găsit.

O astfel de abordare NGS este secvențierea cu pușcă metagenomică (MSS), care determină compoziția nucleotidică a unor cantități mari de molecule de ADN aleatorii recuperate din probe complexe de ADN din diverse surse. Această metodă face posibilă preluarea simultană a informațiilor despre dieta gazdei, microbiomul, paraziții intestinali, precum și structura populației speciei 1. Deși are un potențial vast pentru biologia conservării, puține studii au folosit MSS pentru reconstituirea dietei animalelor și niciunul nu a făcut acest lucru pentru păsările erbivore.

O zi tipică în câmpurile situate deasupra cercului polar polar din Tromsø, Parcul Național Dividalen, Norvegia

Cocosul vestic (Tetrao urogallus), sau cocoșul de lemn, este o specie emblematică care poate fi găsită în pădurea de conifere din Eurasia. Extrem de sensibile la nivelurile crescute de distrugere și fragmentare a habitatelor, populația lor în scădere le-a plasat pe lista roșie a Uniunii Internaționale pentru Conservarea Naturii (IUCN) în cea mai mare parte a Europei occidentale și centrale 2. Studiind alimentația urogelului, am putea obține indicii despre resursele pe care le necesită și despre celelalte specii cu care interacționează în habitat, informând strategii mai bune de conservare. Prin observarea animalelor și identificarea morfologică a rămășițelor vegetale din probele lor fecale, s-a stabilit că dieta cocoșului constă în cea mai mare parte din ace de pin în timpul iernii și specii de Vaccinium în timpul verii 3 .