Revizuirea anuală a biofizicii

arn-ului

Vol. 47: 569-593 (Data publicării volumului mai 2018)
Publicat pentru prima dată ca o revizuire în avans, pe 29 martie 2018
https://doi.org/10.1146/annurev-biophys-070317-032923

Victoria Globyte, 1 Sung Hyun Kim, 1,2 și Chirlmin Joo 1

1 Institutul de Nanostiințe Kavli și Departamentul de Bionanoscience, Universitatea de Tehnologie Delft, 2629 HZ Delft, Olanda; e-mail: [e-mail protejat], [e-mail protejat], [e-mail protejat]

2 Școala de Științe Biologice, Universitatea Națională Seoul, Seul 08826, Republica Coreea

Abstract

Majoritatea proceselor de zi cu zi din viață implică necesitatea ca o entitate să își localizeze ținta. La nivel celular, multe proteine ​​trebuie să-și găsească ținta pentru a-și îndeplini funcția. De la reglarea expresiei genelor până la repararea ADN-ului până la apărarea gazdei, numeroase proteine ​​care interacționează cu acidul nucleic folosesc mecanisme distincte de căutare. Mai multe proteine ​​realizează acest lucru cu ajutorul firelor scurte de ARN cunoscute sub numele de ghiduri. Această revizuire se concentrează pe progresele cu o singură moleculă care studiază mecanismul de căutare și recunoaștere a țintelor sistemelor Argonaute și CRISPR (grupate în mod regulat, intercalate cu repetiții scurte palindromice). Discutăm diferiți pași implicați în căutare și recunoaștere, de la prearanjarea complexă inițială în starea competentă de căutare țintă până la pașii finali de corectură. Ne concentrăm pe mecanismele de căutare a țintelor, care variază de la interacțiuni slabe, la difuzie unidimensională și tridimensională, până la corectură conformațională. Comparăm mecanismele Argonaute și CRISPR cu un sistem de căutare țintă bine studiat, RecA.