Un rezumat zilnic de lucrări științifice despre microbiomi, de către echipa MD. Fondată de Elisabeth Taurus, consultant în microbiom și integritate științifică. Twitter: @microbiomdigest

digest

Bloguri de la SJC astăzi în drum spre Vancouver. Microbi orali corelați cu migrene provocate de alimente, leziuni ale măduvei spinării, compararea a 8 truse de extracție a ADN-ului pe 3 tipuri de probe, mockrobiota.

Locuri de muncă și evenimente

Zboară astăzi la Vancouver pentru a susține o scurtă discuție la sesiunea Microbiome Microbiome de la DNA Genotek la # ASHG2016

Microbiom oral uman

Microbiomul pielii umane

Modele animale

Disbioza intestinală afectează recuperarea după leziuni ale măduvei spinării - Kristina A. Kigerl - Journal of Experimental Medicine

Tehnici

Bioinformatică și metagenomică

Microbii în știri

Microbi și bani

Probioticele vaginale, analiza criminalistică a bacteriilor pielii pe țesături, Wolbachia în nematode, filosfera iederii, viața microbiană în două extreme polare, modul de îmbunătățire a mediului interior și analiza specificațiilor de masă a moleculelor habitatului uman.

Sarcina și viața timpurie

Microbiom uman general

Recenzie: Disparități de sănătate și microbiom - Keisha Findley - Tendințe în microbiologie

Microbiom respirator uman

Microbiomul pielii și țesuturilor umane

Nici un cuvânt despre controalele de extracție, deci procedați cu precauție: Comunități bacteriene asociate cu plăci aterosclerotice de la indivizi ruși cu ateroscleroză - Elvira E. Ziganshina - PLOS ONE

Microbiomul intestinal uman

Recenzie: Microbiota intestinală și chirurgia gastro-intestinală - Kristina Guyton - Recenzii despre natură Gastroenterologie și hepatologie

Revizuire: Microbiota intestinală și riscul de a dezvolta boala celiacă - Cenit, Maria C. - Journal of Clinical Gastroenterology

Editorial: Ce este în microbiul dvs. GI? - Martin H. Floch - Journal of Clinical Gastroenterology

Modele animale și in vitro

Microbiom animal

Microbiom de plante, rădăcini și sol

Microbiom de apă și extremofil

Microbiom de mediu construit

Microbiologia alimentară

Bioinformatică și metagenomică

Microbii în știri

Isteria bacteriilor

Știință, publicare și carieră

Markeri fecali pe mâinile copiilor din Bangladesh, Clostridium difficile la câinii de companie, microbi intertidali și variabilitatea bacteriilor aeriene de uz casnic.

Microbiomul pielii umane

Microbiom respirator uman

Tractul urinar și reproductiv uman

Numai metode, fără rezultate (sau: cum să scrieți două lucrări în loc de una): Metodologie pentru un studiu vaginal și urinar de microbiomi la femei cu incontinență urinară mixtă - Yuko M. Komesu - International Urogynecology Journal

Microbiom oral uman

Microbiomul intestinal uman

Experimente pe animale

Microbiom animal

Microbiom de plante, rădăcini și sol

Microbiom de mediu construit

Microbii în știri

Bacterii din răni, oxalobacter și pietre la rinichi, foci de port, șanțuri, lipitori, răspuns la împădurire, lac subglaciar, apă de râu poluată.

Microbiomul pielii și plăgii umane

Microbiomul intestinal uman

Experimente pe animale și alte experimente

Microbiom animal

Microbiom de plante, rădăcini și sol

Microbiom de apă și extremofil

Microbiom de mediu construit

Microbiologia deșeurilor și a poluării

Bioinformatică și metagenomică

Microbii în știri

Microbiomul părului pubian, viromul transplantului pulmonar, semnătura microbiomului IBS, coprolitele, moleculele antibacteriene pentru bebeluși, punga Diavolului Tasmanian, simularea Archaea în Marte, budinca albă, conducta de cartografiere funcțională,

Microbiom oral uman

Microbiom respirator uman

Microbiomul pielii și părului uman

Recenzie: Microbiom în piele sănătoasă, actualizare pentru dermatologi - B. Dréno - Jurnalul Academiei Europene de Dermatologie și Venereologie

Microbiomul tractului reproductiv uman

Microbiomul intestinal uman

Recenzie: Microbiota intestinală și chirurgia gastro-intestinală - Kristina Guyton - Recenzii despre natură Gastroenterologie și hepatologie

Recenzie: Paraziți, microbiote și boli metabolice - Sonakshi Bhattacharjee - Imunologie parazită

Modele animale

Microbiom animal

Microbiom de plante, rădăcini și sol

Microbiom de apă

Microbii în spațiu

Microbiologia alimentară

Microbiologia mediului construit

Tehnici/Ciuperci

Bioinformatică și metagenomică

Microbii în știri

Știință, publicare și carieră

Cercetări de etică și microbiomi, studii de microbiomi simplificatoare, virusurile distrug arheile de pe fundul adânc al mării, Clostridium difficile la pacienții care au paturi de spital.

Microbiom general

Microbiomul intestinal uman

Modele animale

Microbiom de plante, rădăcini și sol

Microbiologia apei (și a coralilor)

Microbiologia alimentară

Tehnici

Metagenomică

Altă microbiologie

Microbii în știri

Seria Gut Conversation:

Știință, publicare și carieră

Alegerile non-microbiologice ale lui Bull

Cu atât de multe universități din Bay Area și companii de științe ale vieții care lucrează la microbiomul uman și la alte comunități microbiene, noi patru (a se vedea mai jos) am crezut că ar avea sens să organizăm un „Meet Area Microbiome Bay Area”. Acest lucru va - sperăm! - fii începutul unei serii de întâlniri pentru a te conecta, a discuta și a împărtăși despre cele mai recente cercetări privind microbiomii.

IndieBio, un accelerator de biotehnologie situat în San Francisco, s-a oferit cu bunăvoință să găzduiască evenimentul luni, 7 noiembrie 2016, între orele 18:00 și 21:00. Tema acestei seri va fi „Comercializarea microbiomului”

Scopul principal al primului nostru eveniment va fi să ne cunoaștem. Vom găzdui profesioniști în microbiomi de la instituții de cercetare de top din Bay Area (de exemplu, UCSF, UC Berkeley, UC Davis și Stanford), precum și organizații de ultimă oră în domeniul științei vieții și biotehnologiei.

Vom începe seara cu o serie de pitch-uri scurte de către reprezentanți ai mai multor companii și start-up-uri de microbiomi din Bay Area, urmată de un panou de întrebări și răspunsuri. Dar cea mai mare parte a serii va fi un mixer într-un cadru informal cu mâncare și băuturi. Aceasta va fi o mare oportunitate de a consolida conexiunile dintre oamenii de știință microbiomi care lucrează în mediul academic și biotehnologie și de a învăța, socializa și de a face rețea.

Evenimentul va fi gratuit, iar băuturile și mâncarea ușoară vor fi oferite, datorită donațiilor generoase de la Second Genome, Assembly Biosciences, One Codex, uBiome, Whole Biome, Osel Inc și gazda noastră IndieBio. Locurile sunt limitate.

Iată un pliant pentru a-l transmite altor persoane care ar putea fi interesate: november-microbiome-meetup-v4 (PDF).

Sperăm că acest Meetup Microbiome va avea un mare succes!

Jun Axup, IndieBio (gazda noastră)
Stephen Martis, UC Berkeley (proiectare poster)
George Roche, UC Berkeley
Elisabeth Taurus, Universitatea Stanford

Sugarii cu bronșiolită, studiul GWAS al receptorilor de vitamina D, efectele pe termen lung ale transplanturilor de scaune, reducerea genomului în endosimbionții de insecte, comunitățile denitrificante din Golful San Francisco, rezomi în seturile de date metagenomice, Picodroplet WGA pentru metagenomică.

Locuri de muncă și evenimente

Sarcina și viața timpurie

Microbiom general uman și multisite

Microbiom oral uman

Microbiom respirator uman

Microbiomul tractului urinar uman

Microbiomul tractului reproductiv uman